За время работы в сбойном режиме компания «Аэроэкспресс» выплатила своим пассажирам компенсации на сумму порядка 80 тысяч рублей, включая стоимость билетов на аэроэкспрессы и на авиарейсы. Был оформлен возврат стоимости проезда на аэроэкспрессе 9 пассажирам, общей суммой 4 тысячи рублей. Также компания «Аэроэкспресс» добровольно взяла на себя обязательства по компенсации стоимости авиабилетов пассажирам, опоздавшим на свои рейсы из-за изменений в графике движения поездов, независимо от причин, вызвавших сбой. Общая сумма выплат по авиабилетам составила более 76 тысяч рублей.
Политика возврата денежных средств в компании действует уже несколько лет и предполагает компенсацию полной стоимости билетов на аэроэкспрессы, если задержка поезда составляет более 15 минут.
С 13.00 часов 24 июня 2013 года график движения поездов на направлении «Аэропорт Домодедово – Павелецкий вокзал» полностью нормализован, аэроэкспрессы курсируют по расписанию.